Liste par ordre systématique
Miniopteridae
Molossidae
Rhinolophidae
Vespertilionidae
- Barbastella barbastellus (Schreber, 1774) Barbastelle d'Europe
- Eptesicus nilssonii (Keyserling & Blasius, 1839) Sérotine de Nilsson
- Eptesicus serotinus (Schreber, 1774) Sérotine commune
- Hypsugo savii (Bonaparte, 1837) Vespère de Savi
- Myotis alcathoe Helversen & Heller, 2001 Murin d'Alcathoe
- Myotis bechsteinii (Kuhl, 1817) Murin de Bechstein
- Myotis blythii (Tomes, 1857) Petit Murin
- Myotis brandtii (Eversmann, 1845) Murin de Brandt
- Myotis capaccinii (Bonaparte, 1837) Murin de Capaccini
- Myotis daubentonii (Kuhl, 1817) Murin de Daubenton
- Myotis emarginatus (E. Geoffroy, 1806) Murin à oreilles échancrées
- Myotis escalerai Cabrera, 1904 Murin d'Escalera
- Myotis myotis (Borkhausen, 1797) Grand Murin
- Myotis mystacinus (Kuhl, 1817) Murin à moustaches
- Myotis nattereri (Kuhl, 1817) Murin de Natterer
- Nyctalus lasiopterus (Schreber, 1780) Grande Noctule
- Nyctalus leisleri (Kuhl, 1817) Noctule de Leisler
- Nyctalus noctula (Schreber, 1774) Noctule commune
- Pipistrellus kuhlii (Kuhl, 1817) Pipistrelle de Kuhl
- Pipistrellus nathusii (Keyserling & Blasius, 1839) Pipistrelle de Nathusius
- Pipistrellus pipistrellus (Schreber, 1774) Pipistrelle commune
- Pipistrellus pygmaeus (Leach, 1825) Pipistrelle pygmée
- Plecotus auritus (Linnaeus, 1758) Oreillard roux
- Plecotus austriacus (J.B. Fischer, 1829) Oreillard gris
- Plecotus macrobullaris Kuzjakin, 1965 Oreillard montagnard
- Vespertilio murinus Linnaeus, 1758 Sérotine bicolore
